这年冬十月，雍正令川陕总督年羹尧为抚远大将军进驻西宁，以四川提督岳钟琪为奋威将军，参赞军务，平定叛乱。

丹津以青海沙拉图为根据地，派兵攻打西宁附近小城、驿站。

年羹尧分兵出永昌、布隆吉河，防其内乱，南守巴塘、里塘、黄胜关，堵住叛军入藏之路，又请富宁安等屯吐鲁番及噶斯泊，断其通准部之路，又派兵分攻镇南、申中等堡。

罗卜藏丹津开始害怕起来，释放了常寿。

他上表请和，雍正不答应。

第二年正月，岳钟琪进攻西宁东北的部隆寺，斩敌6千。

年羹尧率兵2万进攻在柴达木负隅顽抗的罗卜藏丹津。

二月岳钟琪夜袭哈达河，一夜进军160里，黎明突至，叛兵还没起身，罗卜藏丹津穿妇人衣逃跑。

清兵紧追，日行3百里，几天后到达青海、西藏交界的桑骆海。

俘获罗卜藏丹津的母亲、弟、妹和叛军头目，杀叛军8万。

四月，岳钟琪以2万兵进剿罗卜藏丹津余部，在庄浪卫的西山俘杀叛军5千，其余投降，罗卜藏丹津投奔准噶尔首领策妄阿拉布坦。

岳钟琪班师回朝。

此后，青海归入清朝版图，西宁卫改为西宁府，青海地区的蒙古族分为29旗，各设扎萨克（意为一旗之长）治理。

两平金川

两平金川指乾隆十二年（1747）与三十六年（1771）先后派兵平定大小金川叛乱。

金川是指大渡河上游两条支流，一叫大金川，一名小金川，都因临河的山上有金矿而得名。

这里崇山峻岭，气候恶劣，民俗尚武。

大金川头目莎罗奔因雍正元年随岳钟琪进藏平叛有功，授金川安抚司，势力逐渐加大，图谋地方霸权，攻掠临近土司。

他想吞并小金川，首先通过婚姻关系，把侄女阿扣嫁给小金川土司泽旺。

泽旺之弟良吉尔与阿扣私通。

乾隆十年，良吉尔勾结莎罗奔，袭取小金川，诱执泽旺，夺走印信，阿扣改配良吉尔。

乾隆十二年莎罗奔又进攻革布什咱与明正两土司，四川巡抚纪山派副将张兴、游击陈礼镇压，反为所败，十二月两将丧师身陨。

这年六月乾隆帝派云贵总督张广泗为川陕总督，统兵3万，进攻莎罗奔的3千兵马。

金川番兵筑碉，层层设防。

石碉用石头砌成，有20至50米高，四周有小孔，可以放枪。

张广泗初战告捷，但后来为石碉所阻，寸步难行。

第二年乾隆又命大学士讷亲为经略并起用岳钟琪为提督助战。

讷亲刚愎自用，一开始就限3日拿下莎罗奔侄子据守的噶尔厓，结果总兵任举、参将买国良战死。

无奈的讷亲将兵权交给张广泗。

由于莎罗奔有间谍良尔吉、阿扣，军机尽泄，战不利。

张广泗与讷亲又不相协，各持己见。

十三年九月，张广泗、讷亲被召回京城，十二月诛张广泗，十四年正月杀讷亲。